付録と補足資料：主な違いを解説

ジャスティン・ウォン

成長の責任者

グローバルビジネスとデジタルアーツの学士号を取得し、起業家精神の副専攻を修了しました。

リンクトイン

付録（Appendix）は、作成した文書の内部に綴じ込まれるものです。一方で、補足資料（Supplementary material）は別の場所にホストされ、リンクを通じてアクセスされます。この違いがすべてであり、素材を誰が校正するのか、査読を受けるのか、出版記録の一部としてカウントされるのかなど、そこから生じるすべての違いに繋がります。

これらの結果は多くの人が予想するよりも大きなものであり、出版社によっても意見がはっきりと分かれています。『Nature』は補足情報は査読されるとしています。一方で『IOP Publishing』は、補足ファイルはデフォルトでは査読されず、Version of Record（正式な出版版）の一部を構成しないとしています。どちらの声明も、それぞれの著者向けページに記載されています。以下では、何がどこに属するのか、各大手出版社が実際に何と言っているのか、そして特定のアイテムをどのように分類すべきかについて解説します。

1行で表す違い

付録は文書の一部です。他のすべてのコンテンツと一緒にタイプセット（組版）され、目次に表示され、論文やPDFを持つ読者はすでにそれを手に入れています。補足ファイルは文書の外に存在し、通常はあなたがアップロードしたそのままの未編集のファイルとして、別途取得されます。

『Pediatric Radiology』に掲載された査読付き社説は、実用的な境界線を次のように引き出しています。付録には、読者が参照するための、原稿の主要部分の外に配置された比較的簡潔な資料が含まれます。一方、補足資料には、分量が多いもの、扱いにくいもの、または大判の資料が含まれ、ジャーナルのスタッフによる詳細な校正は行われません。

そこから得られる大まかな目安として、読者が本文を読みながら欲しがるものは付録です。あなたの研究を検証したり再利用したりするためにのみ必要なものは、補足資料です。

付録に入れるべきもの

調査票、短縮された表の完全版、インタビューのスケジュール、コーディングフレーム、同意書、数学的導出、詳細なプロトコルなど。意欲的な読者が議論の途中で参照したくなるような資料です。

APA第7版は書式の規約を定めており、これらは簡単に点数を稼げる部分であるため、正しく設定する価値があります。付録が1つだけの場合、タイトルは Appendix となります。複数ある場合は、本文中で言及されている順序に従って、Appendix A、Appendix B というようにラベルを付けます。それぞれ参考文献リストの後、ラベルを中央に配置し、タイトルを次の行に記載して表示します。そして、本文中のどこかで「Appendix Bを参照」という形で必ずすべての付録に言及しなければなりません。どこからも参照されていない付録は、行き場を失った資料のように見えてしまうからです。

多くの人が間違える2つの慣習があります。付録は参考文献リストの前ではなく、後ろに配置されます。また、並び順は作成した順ではなく、本文中に初めて登場する順番に従います。

補足資料に入れるべきもの

データセット、分析コード、動画や音声、非常に大きな表、拡張された方法論、追加の図など、タイプセットすると記事を圧倒してしまうあらゆるものです。定義する特徴は、重要度ではなく、サイズと「生（RAW）のデータ」であることです。

出版社は現実的な制限を設けています。『Nature』は最大10ファイルまで許可しており、音声や動画はそれぞれ最大30MB、合計150MBまでです。『PLOS』は各ファイルを10MB未満に抑えることを推奨しています。『IOP』は個々のファイルを50MB、記事を含む合計を150MBに制限しています。

ナンバリングの規約は出版社によって異なり、必須事項です。『PLOS』は、本文中で S1 Table、S2 Fig などのように引用し、キャプション内のハイパーリンクからのみアクセスできるようにすることを求めています。後から何十もの補足資料の名前を変更するのは非常に面倒な作業になるため、ファイルを構築する前に、ターゲットとするジャーナルのルールを確認してください。

出版社によって意見が分かれる重要なポイント

このテーマに関する他のページには掲載されていない比較表がこちらです。すべて各出版社の公式の著者向けガイドラインから引用しています。

出版社	査読はあるか？	編集（校正）はあるか？	制限事項
Nature	はい。補足情報（SI）を「論文の結論に直接関連する、査読済みの資料」と説明しています。	いいえ。SIはサブエディットされないと記載されています。	最大10ファイル。音声・動画は各30MBまで、合計150MBまで。
PLOS	ガイドラインページには記載なし。	いいえ。ファイルは提供されたままの状態で公開され、コピーエディットは行われないと記載されています。	1ファイルあたり10MB未満を推奨。Figshareに預託されます。
IOP Publishing	いいえ。デフォルトではファイルは査読に含まれないと記載されています。	いいえ。フォーマット調整や編集は行われず、校正刷り（プルーフ）も提供されません。	1ファイルあたり50MB、合計150MB。各ファイルに個別のDOIが付与されます。

IOPは他社よりもさらに踏み込んで、補足資料はVersion of Record（正式な出版版）の一部を構成しないと明確に述べています。これは重大な記述です。資料自体は利用可能ですが、公式には出版された論文の一部ではないことを意味します。

同じ出版社内のジャーナルであっても異なります。『Journal of Monetary Economics』は、著者に補足資料の提出を推奨しつつも、それらを本論文ほど詳細には査読しないと説明しています。

補足資料は査読されるのか？

正直な答えを言えば、それは完全に出版社に依存するため、思い込みで判断することはできません。このことは、論文の書き方に直接的な影響を与えます。

もし、結果セクションの主張が査読者の目に触れないものに依存している場合、その主張は実質的に査読されていないことになります。補足ファイルを査読しない場において、補足PDFに埋もれた頑健性チェック（robustness check）は、どれほど厳密であっても一切精査されていないことになります。安全なアプローチは、結論が実際に依存しているものはすべて査読対象の論文内に残し、補足スペースは議論を支えるためではなく、再利用や再現をサポートする資料のために使用することです。

関連する落とし穴として、アクセス権を持つ査読者であっても、ファイルを開かないことがよくあります。結果を報告する代わりに「補足表S4を参照」と書くことは、その結果がまるで存在しなかったかのように扱われる典型的な原因になります。

引用可能でインデックス登録されるか？

これも出版社に依存し、ここで実用的な違いが顕著になります。

IOPは各補足ファイルにDOIを付与し、それぞれに一意の識別子を設けることで、引用や発見がしやすくなると説明しています。NatureとPLOSは、個別の識別子は用意せず、論文自身のDOIの下で補足ファイルをホストしています（ただし、PLOSは追加でFigshareにも預託します）。

つまり、補足ファイルは独立して引用できる場合もあれば、論文を通じてのみアクセスできる場合もあります。これに対して付録は、文書の一部であるため独立して引用されることはありませんが、まさにその性質こそが、確実な参照を保証するものとなります。

データ利用可能性に関する声明（Data Availability Statements）は別物

多くの人がこれら2つを混同しがちであるため、区別しておく価値があります。補足資料は論文と一緒にアップロードするコンテンツです。一方で、データ利用可能性に関する声明は、基礎となるデータがどこにあるかを宣言するものであり、その場所は通常、ジャーナルではなく外部のリポジトリです。

Natureのポリシーでは、その声明において方法論や知見を解釈、再現、および発展させるために必要となる最小限のデータセットを記述し、アクセッションコードやリンクを含めることを求めており、大規模なデータセットの共有には公開リポジトリの利用を推奨しています。これにより、データセットはファイルとして添付されるのではなく、参考文献リストに引用されます。

この推奨事項は、それ自体のメリットを考えても従う価値があります。主題別リポジトリにあるデータセットには、永続的識別子、ライセンス、および管理者が付与されます。補足のZIPファイルとしてアップロードされた同じデータセットには、それらのどれも存在しません。

特定のアイテムをどこに置くか決める方法

次の4つの質問を、この順番で考えてみてください。

結論はそれに依存しているか？ もし依存しているなら、本論文に含めるか、学位論文を書いている場合は付録に含めます。査読されない補足スペースに置いてはいけません。

読者は本文を読みながらそれを欲しがるか？ 該当する場合は付録です。検証や再利用のためにのみ必要な場合は補足資料です。

それは説明的な文章ではなくデータか？ データセットである場合は、ファイルとして添付するのではなく、リポジトリに保存してデータ利用可能性に関する声明を書いてください。

タイプセット（組版）できるか？ 動画、コード、インタラクティブな資料はタイプセットできません。他の3つの質問にかかわらず、これで決定します。

学位論文（Thesis）においては、この問題の大部分がシンプルになります。学位論文には付録があり、文書と一緒に製本されるため、補足資料が現実的な問題になるのは、章を論文（Article）に書き直すときだけです。その時点で、付録に収まっていた資料を本論文、補足ファイル、あるいはリポジトリに分類する必要があり、デフォルトですべてを補足資料に移すのではなく、意図的に仕分ける価値があります。

重要な資料は読まれる場所に配置する

この区別は事務的なものに聞こえるかもしれませんが、結果的には「精査（査読）」に関わってきます。付録は審査される対象の内部にあります。補足資料は査読される場合とされない場合があり、校正されることはほとんどなく、出版社によっては公式の出版記録の外に位置づけられます。

その資料があなたの議論においてどのような役割を果たしているかを問い、前回のジャーナルと同じであると思い込まず、投稿先ジャーナルの具体的なポリシーを確認して判断してください。論文の構成を整えることや、研究手法を説明することに注ぐのと同じ細心の注意をここでも払う必要があります。なぜなら、使用されたツールを見つけられない読者は、あなたの研究を評価することができないからです。